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動(dòng)物膜蛋白提取試劑盒(細(xì)胞樣品)
(Animal Membrane Protein Extraction Kit for Cells)
產(chǎn)品貨號(hào) |
名稱 |
規(guī)格 |
RTD8111 |
動(dòng)物細(xì)胞膜蛋白提取試劑盒(細(xì)胞樣品) |
50次 |
● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
動(dòng)物膜蛋白提取試劑盒(細(xì)胞樣品)(Animal Membrane Protein Extraction Kit for Cells)提供了一種簡(jiǎn)便的地從培養(yǎng)細(xì)胞或貼壁細(xì)胞中提取膜蛋白的方法。提取的膜蛋白不僅包括質(zhì)膜上的膜蛋白,也包括細(xì)胞器膜如線粒體膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜和高爾基體膜上的膜蛋白。
本產(chǎn)品與許多用于分離膜蛋白的程序不同,該試劑盒不需要超聲,不需要耗時(shí)的超速離心,不使用去垢劑,最大限度地保持了膜蛋白在細(xì)胞內(nèi)的原始狀態(tài)。提取的基本原理是通過(guò)提取溶液和離心柱的協(xié)調(diào)作用提取得到高純度的膜蛋白。膜蛋白提取溶液可以溫和作用于細(xì)胞膜,改變細(xì)胞的滲透壓,然后在高速離心下細(xì)胞通過(guò)離心柱,這個(gè)過(guò)程中細(xì)胞膜會(huì)破裂;收集液700 g低速離心分離去除細(xì)胞核,因此消除了膜組分中細(xì)胞核組份的污染;隨后上清使用常規(guī)臺(tái)式低溫離心機(jī)(無(wú)需超速離心)16000 g高速離心,沉淀即為膜蛋白。
該產(chǎn)品約60分鐘即可完成培養(yǎng)細(xì)胞膜蛋白的提取。膜蛋白是在溫和、非變性條件下提取的,結(jié)合不同的溶解液,溶解后的膜蛋白可以用于SDS-PAGE變性電泳檢測(cè)、Blue Native非變性電泳檢測(cè)以及等電聚焦電泳等。另外,膜蛋白也可以用于酶活性測(cè)定,免疫沉淀,ELISA測(cè)定等。
對(duì)于細(xì)胞樣品,如果每次使用細(xì)胞的數(shù)量為2-5×106,本試劑盒可以提取125個(gè)樣品;如果每次使用的細(xì)胞數(shù)量為1×107細(xì)胞,本試劑盒可以提取50個(gè)樣品。
● 產(chǎn)品組成
序號(hào) |
產(chǎn)品編號(hào) |
名稱 |
規(guī)格 |
貯存 |
1 |
RTD8111-01 |
膜蛋白提取溶液 |
25 ml |
4℃ |
2 |
PS1020 |
變性蛋白溶解液 |
5 ml |
RT |
3 |
PN1020 |
膜蛋白重懸液(BN電泳用) |
5 ml |
4℃ |
4 |
DM1080 |
膜蛋白增溶液A |
5 ml |
4℃; 配制后-20℃貯存 |
5 |
PL130-01 |
10×膜蛋白A型上樣緩沖液(配套膜蛋白增溶液A使用) |
1 ml |
-20℃ |
6 |
CD-50 |
離心柱套裝 (包含離心柱和2ml連蓋收集管)
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50個(gè) |
RT |
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說(shuō)明書 |
- |
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● 貯存、效期和運(yùn)輸:
根據(jù)標(biāo)簽溫度貯存;一年有效;試劑盒常溫運(yùn)輸。
● 用前必讀:
1. 離心機(jī)請(qǐng)調(diào)整成RCF/g模式,按照離心力設(shè)置離心機(jī)(不要根據(jù)轉(zhuǎn)速rpm模式設(shè)置),所有離心步驟都需要在4℃低溫離心機(jī)中進(jìn)行。
2. 將膜蛋白提取溶液混勻后放置于冰上。將離心柱套入2 ml連蓋收集管中,蓋好管蓋,放置于冰上預(yù)冷。
3. 蛋白提取推薦添加蛋白酶抑制劑(自備,試劑盒不提供),根據(jù)蛋白酶抑制劑母液濃度提前添加在膜蛋白提取溶液中(如抑制劑母液是 100×,添加時(shí)按照1:100添加,即1ml膜蛋白提取溶液添加10μl抑制劑)。研究蛋白磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自備,試劑盒不提供)。
4. 蛋白定量推薦使用BCA方法,可以選擇BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(貨號(hào):RTP7102)。
● 使用方法:
一 培養(yǎng)細(xì)胞膜蛋白提取:
1.1 準(zhǔn)備溶液:
混勻膜蛋白提取溶液,立即放置在冰上。取適當(dāng)量的溶液,在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑(自備,試劑盒不提供),隨后立即放于冰上待用。按照下表大體估算膜蛋白提取溶液使用體積:
細(xì)胞類型 |
培養(yǎng)器皿 |
細(xì)胞數(shù)量 |
細(xì)胞沉淀體積(PCV)(μl) |
膜蛋白提取溶液(μl) |
懸浮細(xì)胞 |
|
2-5×106 |
20-50 |
200 |
|
5-10×106 |
>50 |
500 |
|
貼壁細(xì)胞 |
96孔板 |
~1×105 |
調(diào)整細(xì)胞數(shù)目到2-5×106 |
200 |
24孔板 |
~5×105 |
調(diào)整細(xì)胞數(shù)目到2-5×106 |
200 |
|
6孔板 |
~2.5×106 |
~25 |
200 |
|
25cm2培養(yǎng)瓶 |
~2×106 |
~20 |
200 |
|
75cm2培養(yǎng)瓶 |
~8×106 |
~80 |
500 |
|
35 mm培養(yǎng)皿 |
~2×106 |
~20 |
200 |
|
60 mm培養(yǎng)皿 |
~5×106 |
~50 |
500 |
|
100 mm培養(yǎng)皿 |
~1.5×107 |
調(diào)整細(xì)胞數(shù)目到2-5×106 |
200 |
注: (二百萬(wàn),2×106)HeLa細(xì)胞,其細(xì)胞沉淀體積(PCM,Packed Cell Volume)大約為20 μl。
1.2 準(zhǔn)備細(xì)胞:
1.2.1 對(duì)于貼壁細(xì)胞:細(xì)胞用PBS漂洗一遍,棄PBS;再加入適量PBS,用細(xì)胞刮刀刮下細(xì)胞,或用0.02% EDTA(0.5 mM)溶液處理細(xì)胞使細(xì)胞不再貼壁很緊,并用移液器吹打下細(xì)胞。400 g(~2000 rpm) 4℃離心5 min收集細(xì)胞,盡最大努力吸盡上清,留下細(xì)胞沉淀備用。盡量避免用胰酶消化細(xì)胞,以免胰酶降解需提取的目的蛋白。
1.2.2 對(duì)于懸浮細(xì)胞:400 g(~2000 rpm)4℃離心5 min收集細(xì)胞,用PBS洗一遍,離心收集細(xì)胞,盡最大努力吸盡上清,留下細(xì)胞沉淀備用。
1.3 裂解細(xì)胞膜:
1.3.1細(xì)胞沉淀中加入準(zhǔn)備好的膜蛋白提取溶液(含蛋白酶抑制劑),用移液器吹打重懸細(xì)胞沉淀,渦旋劇烈震蕩30-60秒,冰浴處理10分鐘,間歇2-3混勻。
注:提取溶液使用推薦經(jīng)驗(yàn)值:起始細(xì)胞數(shù)低于5×106加入 200 μl 提取溶液,起始細(xì)胞數(shù)量5×106-1×107加入500 μl提取溶液。如果細(xì)胞數(shù)目低于1×106或高于1×107,建議調(diào)整細(xì)胞數(shù)目在2-5×106范圍內(nèi)。
1.3.2 將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到離心柱中,蓋上管蓋,16,000 g(~13000 rpm) 4℃離心1分鐘,離心后收集管底部會(huì)有沉淀形成。
注:離心柱最大體積為600 μl;確保離心機(jī)可以在10秒內(nèi)達(dá)到16000 g。
1.3.3 棄去離心柱,蓋好2 ml收集管管蓋,用1ml移液器輕柔吹打重懸收集管中的沉淀。
1.4 去除細(xì)胞核:
溶液700 g(~2700 rpm) 4℃離心1分鐘,用200 μl吸頭小心將上清(上清稍有渾濁)轉(zhuǎn)移到新的1.5 ml離心管中。注意:轉(zhuǎn)速不要超過(guò)700g,否則會(huì)降低膜蛋白的得率。
關(guān)鍵步驟:吸取上清時(shí)不要觸及沉淀,甚至可以丟棄部分上清不吸取,以免上清(含膜蛋白)中污染核蛋白。如果使用200 μl提取溶液,建議吸取150 μl上清;使用500 μl提取溶液,建議吸取400 μl上清。此步驟得到的細(xì)胞核純度不高,混雜有沒(méi)有完全破碎的完整細(xì)胞,不建議用于相關(guān)實(shí)驗(yàn)。
1.5 沉淀膜蛋白:
上清溶液16000 g(~13000 rpm) 4℃離心30分鐘,用200 μl吸頭吸棄上清,沉淀即為提取的膜蛋白。上清是胞漿蛋白,如需要可保存?zhèn)溆谩?
關(guān)鍵步驟:此步驟必須完全將上清吸取干凈,可以分次吸取上清,最后用10 μl吸頭將殘余上清徹底吸凈,以免膜蛋白中污染胞漿蛋白。
二 膜蛋白溶解:
膜蛋白沉淀可以根據(jù)下游實(shí)驗(yàn)需求用50 μl相應(yīng)溶解液溶解。
注:不建議加入超過(guò)50 μl溶解液,會(huì)導(dǎo)致蛋白濃度偏低。
2.1 膜蛋白變性樣品處理:
2.1.1 建議使用50 μl變性蛋白溶解液(貨號(hào):PS1020)溶解膜蛋白;
2.1.2 BCA方法測(cè)定蛋白濃度;
2.1.3用變性蛋白溶解液調(diào)整蛋白濃度為1 μg/μl,按需分裝,每管50 μl,-80℃保存待用;
2.1.4取一管50 μl樣品加入SDS-PAGE上樣緩沖液(貨號(hào):PL080,PL113,PL121)處理,建議調(diào)整上樣液濃度為0.5 μg/μl;對(duì)于多次跨膜蛋白(Multi-pass membrane protein)的變性電泳檢測(cè),樣品建議使用37℃處理30分鐘或者70度處理10分鐘,不要95℃加熱5分鐘,因?yàn)樵?5℃高溫情況下,多次跨膜蛋白極易聚集形成多聚體,樣品會(huì)聚集,WB檢測(cè)會(huì)表現(xiàn)為比實(shí)際蛋白大小更大的分子量;
2.1.5 使用SDS-PAGE凝膠(貨號(hào):RTD6132,RTD6116)電泳,每個(gè)泳道上樣10-40 μl(5-20 μg)。
2.2 膜蛋白BN非變性樣品處理:
2.2.1 建議使用50 μl膜蛋白重懸液(BN電泳用)(貨號(hào):PN1020)重懸膜蛋白沉淀;
2.2.2 BCA方法測(cè)定蛋白濃度(貨號(hào):RTP7102);
2.2.3 用膜蛋白重懸液(BN電泳用)調(diào)整蛋白濃度為1 μg/μl,按需分裝,每管50 μl,-80℃保存待用;
2.2.4 取一管50 μl樣品,溶化混勻后4℃ 16000 g 5分鐘,去除上清,保留沉淀;
2.2.5 沉淀中加入50 μl膜蛋白增溶液A(貨號(hào):DM1080),輕柔重懸沉淀,盡量不產(chǎn)生氣泡,冰浴10分鐘;
膜蛋白增溶液A配制方法:在增溶劑粉末管中加入2.5 ml溶解緩沖液,加入超純水精準(zhǔn)定容至5 ml,徹底混勻,增溶液中DDM終濃度為1%。
2.2.6 4℃ 16000 g 15分鐘,取上清至一干凈1.5 ml離心管中即為增溶后膜蛋白溶液(小心不要吸取沉淀),此時(shí)得到的膜蛋白濃度為1 μg/μl,其中去垢劑DDM(n-Dodecyl β-D-maltoside,β-DM n-十二烷基-β-D-麥芽糖苷)終濃度為1%;
2.2.7 膜蛋白溶液中加入1/10體積10×膜蛋白A型上樣緩沖液(配套膜蛋白增溶液A使用)(貨號(hào):PL130),使用BN凝膠電泳(貨號(hào):RTD6139,RTD6140),每個(gè)泳道上樣5-20 μg。
2.3 膜蛋白等電聚焦樣品處理(2D凝膠第一維電泳):
建議膜蛋白沉淀中使用溶解液:7 M尿素,2 M硫脲, 2%CHAPS,20mM DTT(自備,試劑盒不提供)。
三 關(guān)于膜蛋白產(chǎn)量和質(zhì)量的評(píng)價(jià):
3.1 膜蛋白產(chǎn)量:
細(xì)胞系 |
細(xì)胞數(shù)量 |
膜蛋白 |
K562 |
1×107 |
50-80 μg |
Jurkat |
1×107 |
80-100 μg |
Hela |
1×107 |
100-150 μg |
NIH-3T3 |
1×107 |
80-120 μg |
3.2 膜蛋白質(zhì)量評(píng)價(jià):
膜蛋白質(zhì)量評(píng)價(jià)首先看提取的蛋白是否是膜蛋白,其次要看膜蛋白是否有明顯的富集,其三要看提出的膜蛋白是否有其他組分交叉污染,最后看提取的膜蛋白中是否可以檢測(cè)出目的蛋白。使用專門的膜內(nèi)參檢測(cè)(下表),可以初步確認(rèn)提出的是膜蛋白。膜蛋白是否有效富集需要用總蛋白作為對(duì)照,與總蛋白相比,膜蛋白中膜蛋白內(nèi)參是否有明顯富集。膜蛋白中的交叉污染可以用其他組分內(nèi)參檢測(cè)膜蛋白樣品,如關(guān)注膜蛋白中是否有細(xì)胞核蛋白污染,可以使用核蛋白內(nèi)參如Lamin B1檢測(cè)膜蛋白,檢測(cè)無(wú)條帶即說(shuō)明膜蛋白與細(xì)胞核組分無(wú)交叉污染。用目標(biāo)蛋白抗體檢測(cè)膜蛋白,驗(yàn)證是否可以檢測(cè)到目的蛋白,蛋白大小是否符合預(yù)期。
位置 |
內(nèi)參名稱 |
大小 kD |
細(xì)胞膜 |
Na-K ATPase |
100 |
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜 |
Calnexin |
~90 |
線粒體膜 |
COX IV |
17 |
許多研究人員利用 WB對(duì)分離的膜蛋白進(jìn)行純度檢測(cè),經(jīng)常發(fā)現(xiàn)一些常用的胞漿內(nèi)參能在膜蛋白中檢測(cè)到,例如β-actin[1], GAPDH [2] 和 β-tubulin [3],這是由于這些胞漿內(nèi)參不僅存在于胞漿也存在于質(zhì)膜中,因此可以在膜蛋白中檢測(cè)到胞漿內(nèi)參。更多信息,請(qǐng)參閱以下論文:
1. Gruenstein E., et al. (1975). Actin associated with membranes from 3T3 mouse fibroblast and Hela cells. Journal of cell Biology. 64:223-234.
2. Terrasse R., et al. (2012). Human and pneumococcal cell surface glyceraldehydes -3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) proteins are both ligands of human C1q protein. J. Biol. Chem. 287:42620-42633.
3. Wolff J. (2009). Plasma membrane tubulin. Biochemica et BiophysicaActa. (BBA)-Biomembranes 1788:1415-1433.
四 實(shí)驗(yàn)示例:
樣品:K562細(xì)胞,膜蛋白提取試劑盒提取膜蛋白(M)和胞漿蛋白(C),RIPA提取總蛋白(TP)
溫度處理:樣品與SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液(貨號(hào):PL080)混合,37度處理30min,70度處理10min,95度處理5min
電泳:4-18% RealPAGE預(yù)制膠(貨號(hào):RTD6119-0420),蛋白上樣量均為5 μg,恒壓200V 55min
轉(zhuǎn)膜:0.45μm PVDF膜,1×RealBlot轉(zhuǎn)膜緩沖液(貨號(hào):RT5020)濕轉(zhuǎn),恒流400 mA 35min。
封閉:快速封閉液(貨號(hào):WR5020) RT 10 min
剝離:Western一抗二抗去除液(弱堿,溫和型) (貨號(hào):WS1200),37度搖床15 min
一抗:1 Na-K ATPase 1:5000;2 Calnexin 1:500;3 β-Tubulin 1:5000 ;4 β-Actin 1:10000;5 GAPDH 1:10000; 6 H3 1:10000;7 COXIV 1:5000;常溫?fù)u床孵育60min
二抗:羊抗兔IgG-HRP 1:5000(貨號(hào):HGR1020),羊抗鼠IgG-HRP 1:5000(貨號(hào):HGM1060),常溫?fù)u床孵育60min
檢測(cè):ECL發(fā)光檢測(cè)(貨號(hào):EC2520)
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